对于小的肾囊肿治疗，目前医学上缺少特效的肾囊肿治疗方法。无症状时普遍认为肾囊肿不需要做任何治疗，只须要定期复查，观察囊肿是否继续增大;如发现明显的增大，才要及早重视肾囊肿治疗。肾囊肿增长迅速，压迫肾脏正常组织的危害已得到世界普遍的重视，都在进行深入的研究。肾囊肿的治疗方法较多，有穿刺治疗和保守治疗方法。需要根据具体的病情而定，专家可能依据具体的病情制定具体的肾囊肿治疗方法。采取治疗前，无症状者应经常进行尿液检查，包括尿常规、尿培养，每半年至1年进行一次肾功能检查，包括内生肌酐清除率。由于感染是本病恶化的重要原因，所以不在十分必要时，不要进行尿路创伤性检查。
肾囊肿一般治疗方法
囊肿直径少于4cm，无肾盂肾盏明显受压，无感染、恶变、高血压，或症状不明显者，只需密切随访观察，定期B超复查。
(一)穿刺放液+硬化剂治疗
1.适应证 本方法适用于囊肿直径大于4cm，有症状，经检查排除恶性变感染的患者。
2.常用硬化剂、四环素、磷酸锁、95%的酒精、50%葡萄糖。
3.禁忌证 局部皮肤有感染者，有严重出血倾向的患者。
4.并发症 出血、感染、血气胸、肾撕裂伤，动静脉瘘、损伤性尿囊肿及硬化剂外渗对肾周围组织的刺激和损害。
(二)穿刺放液加抗生素治疗
1.适应证 直径大干4cm时肾囊肿合并囊内感染者。 B超引导下穿刺放液后，根据可能感染的菌株再注入敏感的抗生素。
2.禁忌证和并发症与穿刺加硬化剂相同。
(三)手术治疗
1.适应证(方法有开放手术及腹腔镜)
(1)囊肿合并感染，穿刺放液加抗生素治疗失败。 (2)囊肿恶性变。(3)穿刺加硬化剂治疗失眠。(4)巨大肾囊肿。
2.禁忌证 严重心肺肝肾功能障碍不能耐受手术，囊肿恶性变有远处转移者。
3.术式选择
(1)囊肿去顶术，适用于绝大多数肾囊肿患者; (2)肾切除，适用于囊肿恶性变或囊性肾癌。
4.术后并发症常为感染、出血、尿瘘。腹腔镜术后抗并发症有气检、皮下及纵隔气肿、肠管损伤出血、感染等。
